Die Funktionsanalyse ist ein wichtiger Baustein für die ätiologische Beurteilung, der Therapieform und der Prognose. Die Funktionsanalyse gliedert sich in drei Teile: 

Untersuchung der Ruheschwebe- und Schlussbissstellung und des intaoralen Raumes 

Untersuchung des Kiefergelenkes 

Untersuchung auf orofaziale Dyskinesien, besonders mit Beurteilung des Schluckens, der Sprache , des Muskeltonus (z.B. Lippe) und der Atmung.